En 1995, les accords de Dayton mettaient la fin officielle au conflit en Bosnie Herzégovine, Depuis, les chemins de fer continuent leur renaissance. La situation s’améliore progressivement pour offrir aux Bosniaques, un service ferroviaire de qualité, et amarrer le réseau aux couloirs transeuropéens.

Les chemins de fer de Bosnie sont nés en 1872, avec l'ouverture d'une ligne de Dobriljn à Banja Luka, dans les dernières années de l'empire Ottoman. Ils se developpent sous la période austro-hongroise du pays de 1878 à 1914, avec la construction d'un réseau à l'écartement standard, mais aussi de réseaux secondaires aux écartements de 760 ou meme 600 cm. En 1882, le rail arrive à Sarajevo. Durant cette période, le réseau ferroviaire tous écartements confondus à plus de 1600 km. Au lendemain de la première guerre mondiale, la Bosnie est integrée au royaume des Serbes, Croates et Slovènes, avant de devenir une des entités de la Yougoslavie à partir de 1948. Le réseau ferroviaire passe alors au sein de la Communauté des chemins de fer Yougoslaves (Zajednica Jugoslovenske Zeleznice). Les voies étroites sont sont reconverties à la voie normale, ou fermée. L'une des reconversion la plus spectaculaire est celle de la ligne Sarajevo - Ploce. En 1945 est inauguré le port de Ploce, sur l'Adriatique, dont la construction a débuté en 1936. Pour écouler les marchandises, une ligne a voie normale est construite entre Ploce et Sarajevo à partir de 1958, avec réutilisation partielle de la plateforme de la voie étroite existante. Elle ouvre à la circulation en 1966, et l'ectrification est mise en service en 1969. La dernière ligne a voie étroite ferme en 1979, marquant la fin d'un réseau qui a compté jusqu'a 1700 km de ligne. Les jeux Olympiques de 1984 à Sarajevo motivent une modernisation lourde du réseau dès 1979. Mais en 1992 débute la guerre de Bosnie, qui ravage le pays. Les liaisons ferroviaires sont progressivement coupées avec les pays voisins. Des milliers de morts, de disparus, une situation difficile qui se conclus par les accords de Dayton, signés le 14 décembre 1995 à Paris par les belligérants (Croates, Bosniaques, Serbes). Ils partionnent la Bosnie en deux entités : La Fédération de Bosnie Herzégovine qui regroupe les Croates (avec un statut particulier pour la région de Mostar) et les Bosniaques musulmans, et la Republika Srpska, la République serbe de Bosnie, regroupant les Serbes orthodoxes. Néanmoins, l’unicité du pays est garantie par des institutions et une capitale (Sarajevo) communes. Le réseau ferroviaire a souffert avec la destruction de ponts, de l'infrastructure, et du matériel.. les réseaux européens viennent en aide aux chemins de fer de Bosnie, en leur donnant du matériel tant fret que voyageurs. Ce dernier sera essentiellement fournit par DB et SJ.

Organisation

Du coté ferroviaire, l’organisation prend modèle sur le politique. Trois entreprises voient le jour :
- Željeznice Srpske devenu Željeznice Republike Srpske, exploite un réseau de 415 km, dont 330 sont électrifiés. Il s’articule autour de l’axe Dobrljin – Novi-Grad - Banja Luka – Doboj – Maglaj. Les ZRS ont leur siège à Doboj.
- Željeznice Bosne i Hercegovine assure l'exploitation du réseau entre Visoko et Zavidovici via Zenica et d’Hadžici à Jablanica via Konjic.
- Željeznice Herceg-Bosne, opère dans la partie croate, située au sud-est de la Bosnie, avec les trains régionaux circulant entre Bacevici et Capljina.
En 1998, les ŽBH et les ŽHB fusionnent ce qui permet la création des Željeznice Federacije Bosne i Hercegovine (Željeznice Bosne i Hercegovine). Les ŽRS continuent l'exploitation de leur partie du réseau.
Le 1er janvier 1999 est créé une autorité d’état : Željeznicke javne korporacije BiH (ZJKBiGH) elle gère l’infrastructure, le trafic international, les liaisons inter-entités, et les relations avec l’union européenne.

Aujourd'hui, le réseau bosniaque comporte 1032 km de voie (59% du réseau est sur l'entité ZFBIH). 75% du réseau est électrifié.

Le trafic voyageurs

Le trafic voyageurs repose essentiellement sur des voyages sur courte distance. Les services ferroviaires sont essentiellement en concurrence avec les services de bus qui assurent de nombreuses liaisons a travers tout le pays, mais aussi à l'international, il profitent des vitesses commerciales relativement faibles, entre 30 et 70 km/h, des trains.

le trafic international de base est assuré par le train Zagreb - Dobriljn - Banja Luka - Doboj - Zenica - Sarajevo - Mostar - Ploce, qui assure en gare de Zagreb les correspondances sur le Lisinski de et pour Munich. Un train de nuit a places assises assure une liaison directe Sarajevo – Budapest. Il est amorcé Ploce l'été depuis juillet 2005. L’offre est complété par un aller-retour Banja Luka – Doboj – Vinkovci – Beograd.
Le reste du trafic voyageurs est constitué par le trafic régional, autour de Zenica, Sarajevo, Doboj, Banja Luka et B. Novi/Novi Grad.
Depuis 2005, un trafic urbain a même été créé entre Sarajevo et Pazaric.