L'axe international Bruxelles - Basel a perdu de son prestige. Trois trains assurent encore la relation, bien loin du confort et des temps de parcours des défunts TEE.

La BB 26160 est en tête du train 90 Zürich Hb 11h36 - Bruxelles-Midi 19h51 et passe Zoufftgen (30/06/2013 - 16h47)

En mai 1988 est créé le train EC 91-90 Vauban Bruxelles - Bâle en remplacement des trains 390-391. Comme son prédécesseur, il achemine quelques voitures directes pour et de Milan.
Les années 90 sont marquées par la voiture-restaurant, qui change à de nombreuses reprises, soit de parcours, soit de fournisseur. A l'été 1993, c'est une voiture-restaurant FS, qui roule toujours sur le parcours Bruxelles - Milan. Au service d'hiver 1995-1996, c'est la SNCB qui reprend le flambeau avant que la voiture FS réapparaisse sur la prestation à l'été 1997. Au service d'été 1998, la SNCB reprend la fourniture de la voiture-restaurant avec un trajet limité au parcours Bruxelles-Midi - Bâle SNCF.

Au service d'été 1999, le train 90 voit son sillon horaire modifié : En effet, entre Bâle et Bruxelles-Midi, il inverse son sillon avec celui du train 96. Cette modification entraîne :
- Un départ de Milano-Centrale avancé à 08h.15
- Une circulation hors du service cadencé omnibus Brig - Bern - Bâle et donc, par voie de fait, la suppression des arrêts de Goppenstein, Kandersteg et Frutingen en Suisse.
- Une suppression des arrêts à Colmar et Bruxelles-Central que le 96 ne desservait pas.
Conséquence de ces modifications d'arrêts, une accélération du train de 51 minutes entre Milan et Bruxelles.
Enfin, le 90 récupère à Luxembourg, la voiture-restaurant laissée par le train 97, la modification horaire ne permettant pas de reprendre à Bâle, la voiture-restaurant du 91.

Au service d'hiver 2000-2001, les CFF reprennent en main la fourniture des voitures de la tranche Bruxelles - Milan, la SNCB refusant d'engager ses modernes I11. Au service d'été 2001, la compo du Vauban est à nouveau modifiée : La tranche Bruxelles - Milan est reprise finalement par les FS. La tranche Bruxelles - Bâle comporte à présent une B11u de la SNCB transformée pour le transport de vélos. Cette tranche comporte par aileurs deux voitures FAC type B11tu SNCB facultatives (541 et 542) et reservée à INTERSOC. Nouvel épisode le 15 décembre 2002, la tranche Milan perd ses voitures FS : la SNCB reprend la fourniture de cette rame. Toutefois, chose inédite, ce sont des voitures I11 qui sont introduites sur ce train par la SNCB. C'est la première fois que ces voitures circulent en France.
Retour à la case départ le 13 décembre 2003, à l'occasion de l'entrée en vigueur du service annuel 2004, les voitures I11 sont retirées, au profit du retour des voitures des FS sur la tranche Milano.

Mais à l'occasion de l'entrée en vigueur du service annuel 2005 en décembre 2004, le Vauban perd ses voitures italienne. Il retrouve une composition intégralement fournie par la SNCB, avec notamment des voitures I11. C'est la conséquence à sa limitation au parcours Bruxelles - Brig. C'était la dernière liaison directe quotidienne entre la Belgique et l'Italie. Au service 2005, les CFF reprennent la fourniture de la rame.

L'année 2007 verra deux modifications successives d'itinéraires pour ce train : Le 10 juin 2007, il est transformé en EC Bruxelles - Interlaken, avant de devenir un Bruxelles - Zürich 6 mois plus tard, à l'occasion du service annuel 2008. Au même moment, il perd son statut d'EuroCity sur le réseau Suisse.

Le qualité du train se réduit d'année en année, avec notamment, un temps de trajet long entre Bruxelles et Luxembourg.

En décembre 2012, le train 91 est limité à Bâle. En décembre 2013, le Vauban perd ses voitures CFF au profit d'une rame SNCB. Les voitures Suisses restent présentes néanmoins sur le train pour les renforts. Dans le sens Suisse - Belgique, le train est amorcé Bâle au lieu de Zürich.

Le train 97 Bruxelles-Midi 13h09 - Basel 19h42 passe à Ancerville (57). En tête, deux voitures CFF UIC-X en renfort (OF-09/03/2014 à 17h20)

Au service d'été 1985, les trains IC 394-395 Iris sont remplacés par les trains IC 94 et 95 Chur - Bruxelles Midi via Zurich, Bâle, Mulhouse-Ville, Strasbourg, Metz-Ville, Thionville, Luxembourg, Arlon et Namur. Le train 94 achemine en plus, une tranche de voitures directes Chiasso - Bruxelles.
En Mai 1991, les voitures SNCB remplacent les voitures des CFF. Au service d'été 1993, l'Iris est limité au parcours Bruxelles - Zürich. Il ne fait plus l'objet de remaniements de composition durant son parcours. Les CFF assurent à nouveau la fourniture. Cependant, la voiture-restaurant reste du ressort de la SNCB. A l'été 1994 l'Iris est renuméroté 97-96 et le 96 a son origine reportée à Chur, Il faudra attendre le 2 juin 1997 pour que le 97 pousse sa destination finale de Zürich à Chur. A la même date, ces trains perdent la voiture-restaurant entre la Suisse et le Luxembourg.
Au service d'été 1999, le sillon du 96 est inversé avec le sillon du 90 Vauban. Le 96 récupère donc la voiture-restaurant SNCB à Bâle, arrivée en début d'après-midi par le 91. Il dessert à présent Colmar et Bruxelles-Central.
En décembre 2003, l'Iris récupère les voitures I11 de la SNCB suite à leur retrait du Vauba,. Ce n'est que de courte durée, en décembre 2004, l'Iris perd ses voitures I11 de la SNCB, pour retrouver une composition tout hélevetique. Néanmoins, l'EC 97 se retrouve limité à Zürich Hb.

En décembre 2012, le train 97 est limité à Bâle. En décembre 2013, l'Iris perd ses voitures CFF au profit d'une rame SNCB. Les voitures Suisses restent présentes néanmoins sur le train pour les renforts. Dans le sens Suisse - Belgique, le train est amorcé Bâle au lieu de Zürich.

La 15016 entre en gare de Metz en tête de l'EC296 "Edelweiss" Zürich Hb - Bruxelles-Midi (OF-21/06/1997)

*Eté 1979 : les TEE 93-90 Edelweiss sont supprimés. En remplacement, un train de 1ère et 2nde classe 497-496 Bruxelles Midi - Zürich est créée. Entre Luxembourg et Basel, il est acheminé par la paire de train 297-296 Amsterdam - Basel - Italie.
*Eté 1987 : le train 297 Amsterdam - Maastricht - Bâle a son horaire retardé de 40 minutes. Les voitures Bruxelles - Zürich des trains 297 et 296 sont limitées à Basel.
*Eté 1989 : le train 297 Amsterdam - Basel prend le numéro 295 et à son terminus repoussé à Roma.
*Hiver 1989/1990 : Le train 294 assure quotidiennement la course Rome - Bruxelles. Il achemine à partir de Chiasso, les voitures Milan - Bruxelles du train 298. Le train 295 assure la course Bruxelles - Rome. Il achemine une tranche de voitures directes Maastricht - Bâle entre Luxembourg et Bâle. Le train 296 assure la liaison entre Bâle et Bruxelles avec acheminement jusqu'à Metz de voitures directes Basel - Calais Maritime et jusqu'à Luxembourg, de voitures directes Bâle - Maastricht.
*Hiver 1991/1992 : Le train 294 Rome - Bruxelles achemine entre Bâle et Bruxelles la voiture directe Innsbruck - Bruxelles du train 1168 Arlberg - Express et les voitures Milan - Bruxelles du train 298 entre Chiasso et Bruxelles.
*Hiver 1992/1993 : Pas de changements pour les trains 294 et 295. La tranche Calais-Maritime du 296 est supprimée. Il est donc spécialisé à une desserte Basel - Strasbourg - Metz Ville - Luxembourg - Bruxelles/Maastricht
*Eté 1993 : Le train 294 perd ses voitures estivales Milano - Bruxelles, basculées sur le train 498. Par contre, en plein été, il achemine à partir de Chiasso, des voitures directes Ancona - Bruxelles et Ancona - Calais Maritime. Cette dernière tranche est différée du train à Bâle. Le 295 assure toujours la liaison Bruxelles - Roma avec voitures directes Maastricht - Bâle à partir de Luxembourg. Le train 296 assure toujours ses liaisons entre Bâle et Bruxelles d'une part et Basel et Maastricht d'autre part
*Eté 1994 : Suppression de la tranche Maastricht - Basel des trains 295 et 296. Suite à la dérégularisation de la tranche Rome - Bruxelles, le train 294 est renuméroté 1294. Le train 295 est avancé au départ de Bruxelles-Midi (départ à 15h.13 au lieu de 16.04). Il achemine tous les jours en juillet et août les voitures Bruxelles - Rome
*Eté 1996 : Le train 295 est détourné (sauf les SDF) via les lignes belges 124 & 123, par Nivelles, Charleroi-Sud et Namur. Le départ est reculé à 15h.57 au lieu de 15h.13. Les SDF, il conserve son itinéraire via Ottignies et Bruxelles Quartier Léopold. Ces jours là, il quitte dorénavant Bruxelles-Midi à 16h.10 Sa fourniture est assuré à présent par la SNCB. Le train 296 conserve quotidiennement son itinéraire via Ottignies et Bruxelles-Quartier Léopold. Sa fourniture est également assurée par la SNCB.
*Eté 1997 : Le train 295-296 est amorcés et terminus Zürich Hb avec desserte de Brugg et Baden. Le 296 étant positionné sur le sillon du service cadencé Chur - Basel, il dessert en plus Frick et Rheinfelden. Le 295 achemine toujours entre Bruxelles et Basel les voitures pour Roma-Termini.
*Eté 1998 : Le 295 retrouve quotidiennement son itinéraire via la ligne 161 Bruxelles Midi - Namur via la jonction Nord-Sud
*Eté 1999 : L'Edelweiss est supprimé Il est remplacé par le 295-296 Jean Monnet Bruxelles-Midi - Bruxelles Nord - Bruxelles-QL (Luxembourg) - Namur - Arlon - Luxembourg - Thionville - Metz-Ville - Strasbourg. Les voitures Bruxelles - Roma sont désormais du ressort d'un nouveau train hebdomadaire : Le Freccia Del Tirreno. Celui-ci est supprimé le 15 décembre 2002.

La 15002 sur le train 296 Basel 06h01 - Bruxelles-Midi 13h19 passe à Gosselming (23/05/2007 à 08h33)

La suppression de l'EC Edelweiss en mai 1999 est compensée par la création d'un nouvel EC Strasbourg - Bruxelles désigné Jean Monet. Sa composition est relativement réduite, puisqu'entre Strasbourg et Luxembourg, il est seulement composé de 3 voitures de la SNCB. En décembre 2004, le Jean Monet est supprimé les samedis dans le sens impair, les dimanches matin dans le sens pair. Il est prolongé/amorcé à Bâle tous les jours de sa circulation. Un temps menacé lors de la grande réforme horaire touchant l'Est de la France en juin 2007 suite à la mise en service du TGV Est-Européen, il est finalement repris dans les circulations TER. Sa composition fait désormais appel aux voitures TER Alsace, avec tracé V200 en Plaine d'Alsace. Le 295 marque en plus un arrêt à Saverne.